По экспорту в ММ - плохо, что не сохраняется иерархия уровней задач.
Вообще - идеально было бы организовать экспорт таким образом:
выгрузили в ММ, осмотрели все задачи, что-то подправили и импортировали обратно.
При этом автоматически удаляются задачи, удаленные в ММ и добавляются в соответствующие иерархии новые задачи.